[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: جلد 23، شماره 1 - ( بهار 1401 ) ::
جلد 23 شماره 1 صفحات 12-1 برگشت به فهرست نسخه ها
مقایسه کارایی دو نشانگر کلروپلاستی (psbA-trnH و trnL-F) در تعیین روابط تبارزایی بین گونه‌‌های پلاخور (Lonicera spp.) در ایران
نجمه فتاحی دهکردی، مسعود قاسمی قهساره، بهروز شیران، مجید صیامپور
دانشگاه شهرکرد
چکیده:   (181 مشاهده)
جنس Lonicera از تیره Caprifoliaceae، در زبان فارسی به نام‌های پلاخور، شونگ و یا پیچ امین‌الدوله (Honeysuckle) خوانده می‌شود. شناخت روابط بین گونه‌ای بر اساس روش‌های سنتی مانند ویژگی‌های ریخت‌‌شناسانه و ترکیب‌های شیمیایی گاهی نتایج متناقضی داشته‌اند. در مطالعه حاضر، به منظور بررسی کارایی رمزینه‌‌‌های DNA در تعیین روابط تبارزایی بین 12 گونه از جنس Lonicera زیر کشت در مناطق مختلف ایران از رمزینه‌‌‌های DNA کلروپلاستی (psbA-trnH و trnL-F) استفاده شد. محتوای DNA ژنومی با استفاده از کیت‌‌های موجود استخراج و به منظور تکثیر دو ناحیه مورد نظر واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز (PCR) انجام شد و در نهایت نمونه‌‌های خالص‌‌سازی شده توالی‌یابی گردیدند. نتایج نشان دادند که طول منطقه psbA-trnH و trnL-F به ترتیب در حدود 435-420 و 950-940 نوکلئوتید است. واکاوی پارسیمونی ناحیه psbA-trnH و trnL-F به ترتیب 382 و 886 جایگاه حفاظت شده، 55 و 71 جایگاه متغیر و 15 و 16 جایگاه پارسیمون را نشان دادند. در درخت تبارزایی ایجاد شده با ناحیه psbA-trnH، بیشترگونه‌‌ها به جز L. korolkovii و در ناحیه trnL-F، دو گونه L. korolkovii و L. maackii به خوبی از یکدیگر متمایز شده و در شاخه‌‌های متفاوت قرار گرفتند. تنوع و فاصله ژنتیکی (00/0 تا 209/0) بین گونه‌‌ها در ناحیه psbA-trnH بیشتر از فاصله ژنتیکی (00/0 تا 027/0) ناحیه trnL-F بود. بنابراین، ناحیه psbA-trnH با توجه به تنوع و تکثیر آسان، رمزینه مناسبی برای بررسی تنوع ژنتیکی گونه‌‌های پلاخور است.
واژه‌های کلیدی: نواحی رمزینه، فیلوژنی، نشانگر مولکولی، امین‌الدوله
     
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: بیوتکنولوژی و کشت بافت
دریافت: 1399/11/10 | پذیرش: 1400/3/23 | انتشار: 1401/2/17
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Fattahi Dehkordi N, Ghaemi Ghehsareh M, Shiran B, Siampoor M. Comparison of the Efficacy of Two Chloroplast DNA Marker (psbA-trnH and trnL-F) in Determining the Phylogenetic Relationships among Honeysuckle Species in Iran. IJHST. 2022; 23 (1) :1-12
URL: http://journal-irshs.ir/article-1-526-fa.html

فتاحی دهکردی نجمه، قاسمی قهساره مسعود، شیران بهروز، صیامپور مجید. مقایسه کارایی دو نشانگر کلروپلاستی (psbA-trnH و trnL-F) در تعیین روابط تبارزایی بین گونه‌‌های پلاخور (Lonicera spp.) در ایران. مجله علوم و فنون باغبانی ایران. 1401; 23 (1) :12-1

URL: http://journal-irshs.ir/article-1-526-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
جلد 23، شماره 1 - ( بهار 1401 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله علوم و فنون باغبانی ایران Iranian Journal of Horticultural Science and Technology
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 30 queries by YEKTAWEB 4422