جنس Lonicera از تیره Caprifoliaceae، در زبان فارسی به نامهای پلاخور، شونگ و یا پیچ امینالدوله (Honeysuckle) خوانده میشود. شناخت روابط بین گونهای بر اساس روشهای سنتی مانند ویژگیهای ریختشناسانه و ترکیبهای شیمیایی گاهی نتایج متناقضی داشتهاند. در مطالعه حاضر، به منظور بررسی کارایی رمزینههای DNA در تعیین روابط تبارزایی بین 12 گونه از جنس Lonicera زیر کشت در مناطق مختلف ایران از رمزینههای DNA کلروپلاستی (psbA-trnHو trnL-F) استفاده شد. محتوای DNA ژنومی با استفاده از کیتهای موجود استخراج و به منظور تکثیر دو ناحیه مورد نظر واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) انجام شد و در نهایت نمونههای خالصسازی شده توالییابی گردیدند. نتایج نشان دادند که طول منطقه psbA-trnH و trnL-F به ترتیب در حدود 435-420 و 950-940 نوکلئوتید است. واکاوی پارسیمونی ناحیه psbA-trnHو trnL-Fبه ترتیب 382 و 886 جایگاه حفاظت شده، 55 و 71 جایگاه متغیر و 15 و 16 جایگاه پارسیمون را نشان دادند. در درخت تبارزایی ایجاد شده با ناحیه psbA-trnH، بیشترگونهها به جز L. korolkovii و در ناحیه trnL-F، دو گونه L. korolkovii و L. maackii به خوبی از یکدیگر متمایز شده و در شاخههای متفاوت قرار گرفتند. تنوع و فاصله ژنتیکی (00/0 تا 209/0) بین گونهها در ناحیه psbA-trnHبیشتر از فاصله ژنتیکی (00/0 تا 027/0) ناحیه trnL-Fبود. بنابراین، ناحیه psbA-trnH با توجه به تنوع و تکثیر آسان، رمزینه مناسبی برای بررسی تنوع ژنتیکی گونههای پلاخور است.
Fattahi Dehkordi N, Ghaemi Ghehsareh M, Shiran B, Siampoor M. Comparison of the Efficacy of Two Chloroplast DNA Marker (psbA-trnH and trnL-F) in Determining the Phylogenetic Relationships among Honeysuckle Species in Iran. IJHST 2022; 23 (1) :1-12 URL: http://journal-irshs.ir/article-1-526-fa.html
فتاحی دهکردی نجمه، قاسمی قهساره مسعود، شیران بهروز، صیامپور مجید. مقایسه کارایی دو نشانگر کلروپلاستی (psbA-trnH و trnL-F) در تعیین روابط تبارزایی بین گونههای پلاخور (Lonicera spp.) در ایران. مجله علوم و فنون باغبانی ایران. 1401; 23 (1) :1-12