fa مقایسه کارایی دو نشانگر کلروپلاستی (psbA-trnH و trnL-F) در تعیین روابط تبارزایی بین گونه‌‌های پلاخور (Lonicera spp.) در ایران بیوتکنولوژی و کشت بافت Biotechnology and Tissue culture پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:10pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">جنس </span></span><i>Lonicera</i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> از تیره </span></span>Caprifoliaceae<span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">، در زبان فارسی به نام‌های پلاخور، شونگ و یا پیچ امین‌الدوله (</span></span>Honeysuckle<span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">) خوانده می‌شود. شناخت روابط بین گونه‌ای بر اساس روش‌های سنتی مانند ویژگی‌های ریخت‌‌شناسانه و ترکیب‌های شیمیایی گاهی نتایج متناقضی داشته‌اند. در مطالعه حاضر، به منظور بررسی کارایی رمزینه‌‌‌های </span></span>DNA <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">در تعیین روابط تبارزایی بین 12 گونه از جنس </span></span><i>Lonicera</i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> زیر کشت در مناطق مختلف ایران از رمزینه‌‌‌های </span></span>DNA<span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> کلروپلاستی (</span></span><i>psbA-trnH</i> <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">و </span></span><i>trnL-F</i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">) استفاده شد. محتوای </span></span>DNA<span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> ژنومی با استفاده از کیت‌‌های موجود استخراج و به منظور تکثیر دو ناحیه مورد نظر واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز </span></span>(PCR) <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">انجام شد و در نهایت نمونه‌‌های خالص‌‌سازی شده توالی‌یابی گردیدند. نتایج نشان دادند که طول منطقه </span></span><i>psbA</i>-<i>trnH</i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> و </span></span><i>trnL</i>-<i>F</i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> به ترتیب در حدود 435-420 و 950-940 نوکلئوتید است. واکاوی پارسیمونی ناحیه </span></span><i>psbA-trnH</i><i> </i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">و </span></span><i>trnL-F</i><i> </i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">به ترتیب 382 و 886 جایگاه حفاظت شده، 55 و 71 جایگاه متغیر و 15 و 16 جایگاه پارسیمون را نشان دادند. در درخت تبارزایی ایجاد شده با ناحیه </span></span><i>psbA</i>-<i>trnH</i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">، بیشترگونه‌‌ها به جز </span></span><i>L. korolkovii</i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> و در ناحیه </span></span><i>trnL-F</i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">، دو گونه </span></span><i>L. korolkovii</i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> و </span></span><i>L</i>. <i>maackii</i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> به خوبی از یکدیگر متمایز شده و در شاخه‌‌های متفاوت قرار گرفتند. تنوع و فاصله ژنتیکی (00/0 تا 209/0) بین گونه‌‌ها در ناحیه </span></span><i>psbA-trnH</i> <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">بیشتر از فاصله ژنتیکی (00/0 تا 027/0) ناحیه </span></span><i>trnL-F</i> <span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:">بود. بنابراین، ناحیه </span></span><i>psbA-trnH</i><span lang="FA" style="font-size:12.0pt"><span b="" nazanin="" style="font-family:"> با توجه به تنوع و تکثیر آسان، رمزینه مناسبی برای بررسی تنوع ژنتیکی گونه‌‌های پلاخور است.</span></span></span></span></span></span></div> <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="tab-stops:14.2pt"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="font-size:12.0pt">The genus <i>Lonicera</i> belongs to the Caprifoliaceae family, and in Persian, it is called P</span><span lang="EN-GB" style="font-size:12.0pt">a</span><span style="font-size:12.0pt">lakhor, Shung, or Aminoddoleh</span><span style="font-size:12.0pt">. </span><span style="font-size:12.0pt">Understanding interspecific relationships based on traditional methods such as morphological features and chemical compositions has conflicting results</span><span style="font-size:12.0pt">. In this study, to evaluate the efficiency of DNA barcode in determining the </span><span style="font-size:12.0pt">phylogenetic</span> <span style="font-size:12.0pt">relationships of 12 species of <i>Lonicera</i> under cultivation in different regions of Iran, two chloroplast DNA barcodes (<i>psbA-trnH</i> and <i>trnL-F</i>) were used</span><span style="font-size:12.0pt">. Genomic DNA extracted using available kits, and PCR reaction performed to amplify two regions, and finally, purified samples were sequenced.</span> <span style="font-size:12.0pt">The results showed that the length of the <i>psbA-trnH</i> and <i>trnL-F</i> region are about 420-435 and 940-950 nucleotides, respectively. Parsimony analysis of <i>psbA-trnH</i> and <i>trnL-F</i> showed 382 and 886 </span><span lang="EN-GB" style="font-size:12.0pt">conserved</span><span style="font-size:12.0pt"> sites, 55 and 71 variable sites, and 15 and 16 Parsimony </span><span lang="EN-GB" style="font-size:12.0pt">informative</span><span style="font-size:12.0pt"> sites, respectively. Phylogenetic trees created by the <i>psbA</i>-</span><span class="Char" new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black"><i><span lang="EN-GB" style="font-size:12.0pt">trnH</span></i></span></span><span style="font-size:12.0pt"> and the <i>trnL-F</i> regions showed that most species (except <i>L</i>. <i>korolkovii</i>) and the two species <i>L</i>. <i>korolkovii</i> and <i>L</i>. <i>maackii</i> were well distinguished from each other, respectively and they were placed in different clusters.</span> <span style="font-size:12.0pt">The genetic distance (0.00 to 0.209) between species in <i>psbA-trnH</i> region is more than genetic distance (0.00 to 0.027) in <i>trnL-F</i> region. Therefore, the <i>psbA-trnH</i> region </span><span lang="EN" style="font-size:12.0pt">owing to its diversity and reproducibility is a suitable </span><span style="font-size:12.0pt">bar</span><span lang="EN" style="font-size:12.0pt">code for studying genetic diversity between <i>Lonicera </i>species.</span></span></span></span></span></span></div> نواحی رمزینه, فیلوژنی, نشانگر مولکولی, امین‌الدوله Barcode regions, Phylogeny, Molecular marker, Honeysuckle 1 12 http://journal-irshs.ir/browse.php?a_code=A-10-424-2&slc_lang=fa&sid=1 Najmeh Fattahi Dehkordi نجمه فتاحی دهکردی nfatahid.1992@gmail.com 10031947532846008646 10031947532846008646 No Shahrekord University دانشگاه شهرکرد Masood Ghaemi Ghehsareh مسعود قاسمی قهساره mghasemi1352@gmail.com 10031947532846008647 10031947532846008647 Yes Shahrekord University دانشگاه شهرکرد Behrooz Shiran بهروز شیران beshiran45@gmail.com 10031947532846008648 10031947532846008648 No Shahrekord University دانشگاه شهرکرد Majid Siampoor مجید صیامپور msiam57@yahoo.com 10031947532846008649 10031947532846008649 No Shahrekord University دانشگاه شهرکرد