fa واکاوی مولکولی برخی نژادگان‌‌های انبه جنوب ایران براساس ناحیه بین ژنی trnH-psbA بیوتکنولوژی و کشت بافت Biotechnology and Tissue culture پژوهشي Research <div style="text-align: justify;"><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">انبه یکی از مهمترین میوه‌‌‌‌های قاره آسیا و مناطق گرمسیر و نیمه گرمسیر دنیاست. در پژوهش حاضر تنوع ژنتیکی درون گونه‌‌ای 30 نژادگان‌ انبه از برخی مناطق دو استان جنوب کشور، کرمان و هرمزگان</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">(رودان، منوجان، فاریاب، جیرفت، عنبرآباد، هیشین، دهکهان و بلوک) از راه ارزیابی </span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">ناحیه بین‌ژنی </span></span><em><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">trnH-psbA</span></span></span></em> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">کلروپلاست مورد بررسی قرار گرفت. پس از نمونه‌برداری از برگ‌های جوان، استخراج </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">و </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">PCR</span></span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">با استفاده از آغازگرهای ژن‌</span></span><em><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">trnH-psbA(IGS) </span></span></span></em>&nbsp;<span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">انجام شد.</span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> محصولات تکثیر شده مربوط به هر یک از نژادگان‌</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">های مورد مطالعه</span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">،</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">پس از تعیین توالی در پایگاه داده </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">NCBI</span></span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">ثبت شدند. واکاوی‌ها و ترسیم دندروگرام روابط فیلوژنتیک و ماتریس تشابه توالی‌‌ها با نرم افزارهای </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">Darwin</span></span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">، </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">Popgene</span></span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">و </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">Mega</span></span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">انجام شد </span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">تا روابط خویشاوندی و فاصله ژنتیکی بین نژادگان‌<strong>‌‌</strong>ها تعیین شود.</span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;"> تجزیه توالی‌‌ها نشان داد که در ناحیه بین‌ژنی </span></span><em><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">trnH-psbA</span></span></span></em> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">در مجموع 361 جایگاه شناسایی شد. بررسی </span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">شباهت توالی نمونه</span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">‌‌</span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">های انبه مورد بررسی با یکدیگر نشانگر یک توالی مشترک 116 جفت بازی در میان آن‌ها بود. </span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">براساس دندوگرام حاصل از تجزیه خوشه</span></span> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">ای، نژادگان‌‌‌ها در چهار گروه مختلف قرار گرفتند</span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">. بر اساس نتیجه‌های حاصل می‌‌توان نتیجه گرفت که </span></span><span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">استفاده از ناحیه بین‌ژنی </span></span><em><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">trnH-psbA</span></span></span></em> <span style="font-family:B Nazanin;"><span style="font-size:12.0pt;">برای مطالعه و شناخت تنوع و روابط درون گونه‌ای انبه مفید بوده است. </span></span></div> <div style="text-align: justify;">Mango is one of the most important fruits in Asia and the tropical and subtropical regions of the world. In this study, the intraspecific genetic variation of 30 mango genotypes (<em>Mangifera indica </em>L.) from some regions (Roudan, Manoojan, Faryab, Jiroft, Anbarabad, Hishin, Dehkahan and Boluk) in two southern provinces of Kerman and Hormozgan was investigated by evaluating the trnH-psbA intergenic region. After sampling the young leaves, DNA extraction was done by using dellaporta method and PCR was conducted using <em>trnH-psbA (IGS)</em> primers. Proliferated products of each genotype were recorded in the NCBI database after sequencing<strong>. </strong>Analysis and drawing phylogenic relationships dendrogram and sequence similarity matrix was done by using Darwin, Popgene and Mega softwares to determine genetic relationships and genetic distances between genotypes. Sequence analysis showed that in the <em>trnH-psbA</em> intergenic region, 361 positions were identified. Studying the sequence homology of all mango samples represented a common sequence of 116 base pairs among them. Based on the dendrogram resulted from cluster analysis, all genotypes classified in 4 groups. Based on the results, it can be concluded that the use of the <em>trnH-psbA</em> intergenic region was useful for studying and identifying the diversity and interrelationships of mango genotypes.</div> انبه, تنوع ژنتیکی درون گونه‌‌ای, DNA بارکدینگ, روابط فیلوژنتیک, نشانگر کلروپلاستی Mango, Intraspecific genetic variation, DNA barcoding, Phylogenetic relationships, Chloroplast markers 449 464 http://journal-irshs.ir/browse.php?a_code=A-10-250-2&slc_lang=fa&sid=1 azizallah Shirzaie عزیزالله شیرزایی shirzaii@yahoo.com 10031947532846007939 10031947532846007939 No دانشگاه زابل mahmod Solouki محمود سلوکی souloki@yahoo.com 10031947532846007940 10031947532846007940 No دانشگاه زابل leila fahmideh لیلا فهمیده leila.fahmideh@yahoo.com 10031947532846007941 10031947532846007941 Yes دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان